参与发掘工作的陕西省考古研究所副研究员张博说，经过一年多的考古发掘，萨迦寺的基本形制已经清楚。“修建于1268年的南寺是一座有两重城墙的城堡式寺院建筑，其完整的立体防御功能具有汉地建筑特点，是那个时代汉藏文化紧密相连的见证。”他说。

　　萨迦寺南寺是“萨迦五祖”之一的大元帝师八思巴委派人修建的。作为由萨迦寺走出的第一位元朝帝师，八思巴不仅使西藏顺利纳入祖国版图，还总领全国的佛教事务，在西藏历史上发挥了巨大作用，对中国多民族统一国家的建立做出了重要贡献。

　　考古人员对萨迦南寺的外城墙、护城河壕沟和两座城门进行了清理发掘，发现外城墙与护城河壕沟实际上是一个整体建筑，底铺卵石的护城河壕沟呈倒梯形，内外两侧平行且均有石头砌成的坚固护坡，外城墙则直接修建在护城河壕沟内侧之上，与高大的内城墙相配合，构成了一套完整的立体防御系统。

　　“建有防御系统在藏区的寺院、宫殿建筑中是没有的，而在汉地平原的城市建筑上却十分普遍。”张博说：“八思巴跟随元朝皇帝忽必烈长期在汉地生活，因此，他创建的这个寺院吸收了内地平原城市的建筑特色。”

　　除南寺外，考古人员还对时代较早的萨迦北寺进行了考古发掘。北寺最初是由吐蕃贵族昆氏家族1073年修建在仲曲河北岸的温波山南坡，经元代的大发展成为包括拉康(佛殿)、贡康(护法神殿)、颇章(宫殿)等在内的建筑群，多毁于20世纪60年代。

　　站在海拔4300多米的确颇章的宫殿遗址上，主持考古发掘工作的陕西省文物考古研究所副所长张建林说：“这个遗址位于北寺的偏西侧位置，其内建筑分别是萨迦法主的寝宫、护法神殿和藏药作坊，它们的年代最早可至唐代中晚期，相当于吐蕃晚期，这里出土的部分文物具有明确的汉藏交流特点，如一枚金刚铃上铸造着汉文与藏文的两行明确纪年‘明永乐年制’。”

　　萨迦寺是西藏正式并入元朝的历史见证。元太宗时阔端王与萨迦寺法王萨班1247年举行了著名的“凉州会议”，议定西藏归顺蒙古汗国(元朝)的条件。萨班的侄子八思巴1270年因创制“蒙古新字”即八思巴字被升号为大元帝师。自此，萨迦派十余代法王皆充任元朝帝师，由此形成一种帝师制度。

　　张建林说，萨迦派与元朝皇帝的密切关系也使藏文化迅速推广。北京是元、明、清三代的国都，八、九百年来藏族喇嘛在此传教修行的为数不少。作为藏文化的重要传播地，北京保存了极其丰富的藏族文化遗产。